Category: природа

Category was added automatically. Read all entries about "природа".

aumakua

Про геномику растений

Вы вот скорей всего думаете (если думаете), что у растения есть геном. Типа можно взять кусок растения, выделить ДНК, секвенировать, и всё будет хорошо.
А вот нифига, как обычно :)

Геномов у растения как минимум три. Ядерный, хлоропластный и митохондриальный. У каждого свои особенности, вроде GC-состава, разных частот мутаций, разных механизмов регуляции и т.п. К тому же пропорции яДНК, хпДНК и мтДНК в общей выделенной могут сильно отличаться в зависимости от взятого куска растения. Полностью их разделить -- задача нетривиальная.
Но это только начало.

Ещё растения обожают быть гетерополиплоидами. Фактически ядерный геном может состоять из нескольких разных геномов, которые в ходе эволюции как-то притёрлись друг к другу. Классический пример -- пшеница, там три генома в одном. То есть даже разные элементы общего ядерного генома могут заметно отличаться по отдельным параметрам.

Это всё не так страшно, достаточно знать и учитывать. Настоящее веселье начинается, если вспомнить про патогены и паразитов. В реальной прикладной работе обычно нет времени на выделение и выращивание стерильных культур клеток/тканей, и практически нереально предсказать, чья же ДНК будет в итоге плавать в пробирке.

В общем, при работе с растениями даже в сравнительно простых задачах вроде разработки чувствительного метода молекулярной идентификации (чем я сейчас и занимаюсь) вылезает мнооооооого интересного :)
А вы говорите -- биохакеры, биохакеры...
aumakua

Лытдыбр

Давно собираюсь написать что-то в духе "как я провёл прошлым летом", да всё руки не доходят.
Так что кому интересно - смотрите фоточки вконтактике, доступ там открытый для всех.

А сейчас все помыслы заняты полиморфизмом генов устойчивости к холоду древесных растений, и ночами снятся исключительно хромосомы лиственниц, строчки праймеров и схемы взаимной регуляции транскрипционных факторов. Скорей бы спасительная сессия )
aumakua

Жизнь прекрасна!

Хорошо бывает ясным летним утром пойти в лес. Здоровенные сосны, песок и всё такое.
Встретить рассвет, обожраться земляники, насобирать разных интересных травок.
Найти пару чудесных уголков, скрытых от посторонних взглядов, благо рельеф способствует.
Хорошенько промокнуть от росы и чуть не свалиться в очередное озеро с ряской и лягушками.
Постоять на мосту через речку, наблюдая за рыбаками.
Вернуться домой, выпить чашечку крепчайшего эспрессо и подумать, что как-то так оно и должно быть.